Ce qu’il faut retenir :
La flore intestinale est essentielle à la digestion, à l’immunité et à l’équilibre global de l’organisme.
Certains médicaments – notamment les antibiotiques, anti-inflammatoires, anti-acides et antidépresseurs – peuvent perturber cet équilibre.
Les effets d’un déséquilibre de la flore peuvent être digestifs (ballonnements, diarrhées, …), immunitaires ou même métaboliques à long terme.
Une alimentation riche en fibres et en aliments fermentés peuvent aider à préserver la flore.
Ne pas interrompre un traitement sans avis médical, mais rester attentif à sa santé intestinale et en parler à son médecin.
Introduction
Nous avons tous déjà pris des médicaments, que ce soit ponctuellement pour un rhume ou de façon régulière pour une maladie chronique. Mais savez-vous que certains traitements peuvent perturber l’équilibre fragile de notre flore intestinale ? Cette « seconde peau » invisible, composée de milliards de micro-organismes, joue un rôle essentiel pour notre digestion, notre immunité, et même notre bien-être général. Dans cet article, nous allons découvrir comment certains médicaments peuvent affecter cette flore précieuse, quels en sont les impacts possibles, et surtout comment en prendre soin au quotidien.
Qu’est-ce que la flore intestinale ?
La flore intestinale, aussi appelée microbiote intestinal, est un véritable écosystème vivant qui habite notre intestin. Elle regroupe des milliards de micro-organismes — bactéries, virus, champignons, levures — qui travaillent ensemble pour assurer plusieurs fonctions vitales.
Parmi ses rôles principaux, la flore intestinale aide à digérer les aliments, produit certaines vitamines, protège notre système immunitaire et maintient la barrière intestinale contre les éléments nocifs. Un microbiote équilibré est donc essentiel pour notre santé, tandis qu’une flore intestinale déséquilibrée – une dysbiose – peut favoriser des troubles digestifs, des infections ou même des problèmes plus larges comme des inflammations.
Quels médicaments impactent la flore ?
Certains médicaments peuvent perturber l’équilibre fragile de notre flore intestinale, parfois de façon temporaire, parfois plus durable.
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Les antibiotiques sont les plus connus pour leur impact : en détruisant les bactéries responsables d’une infection, ils éliminent aussi une partie des « bonnes » bactéries de notre microbiote. Cette perte de diversité peut ouvrir la porte à des déséquilibres, voire à la prolifération de bactéries indésirables ;
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Les anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS), souvent utilisés contre la douleur ou les inflammations, peuvent altérer la barrière intestinale et favoriser des irritations ;
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Les antiacides (inhibiteurs de la pompe à protons, IPP), prescrits pour réduire l’acidité gastrique. En modifiant le pH digestif, ils réduisent la diversité bactérienne et favorisent l’émergence de certaines bactéries indésirables, augmentant le risque d’infections intestinales comme celles dues à Clostridium difficile ;
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Certains antidépresseurs et autres traitements au long cours ont également montré, dans des études récentes, une influence sur la diversité et l’équilibre du microbiote.
Tous les médicaments n’ont pas le même effet : certains perturbent fortement la flore, d’autres beaucoup moins, et l’impact varie aussi d’une personne à l’autre.
Effets des médicaments sur la flore intestinale
Lorsque la flore intestinale est perturbée par certains médicaments, les effets peuvent se faire sentir rapidement … et parfois durer dans le temps.
Troubles digestifs immédiats
C’est le signe le plus fréquent d’un déséquilibre du microbiote. Après un traitement antibiotique, par exemple, la destruction massive de bactéries bénéfiques peut entraîner ballonnements, diarrhées ou constipation. Les anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS) peuvent aussi fragiliser la muqueuse intestinale et favoriser des désordres digestifs, notamment s’ils sont pris régulièrement.
Impact sur l’énergie et l’immunité
Le microbiote joue un rôle clé dans la production de certaines vitamines, dans l’absorption des nutriments et dans la modulation du système immunitaire. Lorsqu’il est appauvri (comme après la prise d’antibiotiques ou d’inhibiteurs de pompe à protons), il peut moins bien remplir ces fonctions, ce qui peut contribuer à une sensation de fatigue et à une diminution des défenses naturelles.
Conséquences possibles à plus long terme
Des perturbations prolongées du microbiote peuvent favoriser un état inflammatoire chronique, parfois lié à la prise régulière d’AINS, mais aussi à certaines classes d’antidépresseurs, qui modulent l’équilibre bactérien et peuvent influencer le métabolisme énergétique. Ces modifications ont été associées, dans certaines études, à une prise de poids, à des troubles métaboliques et à une sensibilité accrue à certaines maladies digestives.
En clair, même si tous les médicaments ne provoquent pas les mêmes effets, il est important de connaître leur impact potentiel sur notre flore pour mieux en prendre soin avant, pendant et après le traitement.
Comment soutenir sa flore intestinale pendant une prise de médicaments ?
Certaines prescriptions sont indispensables pour votre santé. Mais cela ne veut pas dire que votre microbiote doit en faire les frais. Voici comment le soutenir.
Miser sur une alimentation protectrice
Pendant (et après) un traitement, chouchoutez vos bactéries en leur offrant ce qu’elles aiment : des fibres (légumes, légumineuses, céréales complètes, fruits, oléagineux) et des aliments fermentés riches en probiotiques comme le yaourt nature, le tofu lactofermenté, le kéfir, le kombucha ou encore la choucroute crue. Ces aliments nourrissent et participent au développement des bonnes bactéries et favorisent un retour à l’équilibre.
Apporter des renforts ciblés
Des probiotiques bien sélectionnés peuvent contribuer à l’équilibre de la flore intestinale, y compris en cas de déséquilibre lié à divers facteurs de mode de vie. Chez DIJO, L’Indispensable probiotiques associe des souches documentées scientifiquement pour soutenir cet équilibre au quotidien.
Limiter les prises inutiles
Les médicaments peuvent avoir un réel impact sur le microbiote, surtout en usage prolongé. Évitez donc l’automédication et parlez toujours avec votre médecin des alternatives possibles ou de la durée optimale du traitement.
En résumé : soutenir son microbiote intestinal, c’est lui offrir une bonne alimentation, éventuellement un coup de pouce ciblé, et limiter les agressions inutiles.
Conclusion
Notre flore intestinale est un écosystème précieux … et fragile. Certains médicaments, indispensables dans de nombreuses situations, peuvent perturber cet équilibre. Bien s’informer, adopter des habitudes alimentaires qui nourrissent nos bonnes bactéries, et limiter les traitements inutiles sont autant de gestes simples pour préserver sa santé intestinale.
Sources :
[1] Inserm, 2021, Microbiote intestinal (flore intestinale) - Une piste sérieuse pour comprendre l’origine de nombreuses maladies, consulté de : https://www.inserm.fr/dossier/microbiote-intestinal-flore-intestinale/#comprendre-le-r%C3%B4le-du-microbiote-intestinal
[2] Huang, C., Feng, S., Huo, F., & Liu, H. (2022). Effects of Four Antibiotics on the Diversity of the Intestinal Microbiota. Microbiology spectrum, 10(2), e0190421. https://doi.org/10.1128/spectrum.01904-21
[3] Rekatsina, M., Paladini, A., Cifone, M. G., Lombardi, F., Pergolizzi, J. V., & Varrassi, G. (2020). Influence of Microbiota on NSAID Enteropathy: A Systematic Review of Current Knowledge and the Role of Probiotics. Advances in therapy, 37(5), 1933–1945. https://doi.org/10.1007/s12325-020-01338-6
[4] Zhang, J., Zhang, C., Zhang, Q., Yu, L., Chen, W., Xue, Y., & Zhai, Q. (2023). Meta-analysis of the effects of proton pump inhibitors on the human gut microbiota. BMC microbiology, 23(1), 171. https://doi.org/10.1186/s12866-023-02895-w
[5] Xu, F., Xie, Q., Kuang, W., & Dong, Z. (2023). Interactions Between Antidepressants and Intestinal Microbiota. Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics, 20(2), 359–371. https://doi.org/10.1007/s13311-023-01362-8
